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CRISPR 101:胞嘧啶和腺嘌呤基编辑器

发布的玛丽传动装置在2020年8月6日上午十点30分00秒

最初发布于2016年8月16日,最后更新于2020年8月6日。

当我们谈到CRISPR应用程序时,经常会出现一个负面的问题:低编辑效率homology-directed修复(HDR)。相比异源端加入, HDR发生的频率相对较低,在不分裂的细胞中,该通路进一步下调。科学家们并没有试图改进HDR,而是开发了两类碱基编辑器:胞嘧啶碱基编辑器(CBEs)和腺嘌呤碱基编辑器(ABEs)。

(也有RNA碱基编辑器,但我们只会在这里介绍DNA碱基编辑器。要了解更多关于RNA碱基的信息,请点击这篇博客:CRISPR 101: Cas13的RNA编辑)

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主题:CRISPR,基本编辑

四位基地编辑记者,实时监控和丰富编辑工作

发布的Alyssa Cecchetelli2020年7月7日上午9:15:00

碱基编辑器在基因组中产生特定的点突变,但与之相比它们效率低下CRISPR / Cas9依赖于双链DNA断裂的编辑。由于这种效率低下,对科学家来说,重要的是不仅要容易识别基本编辑这些事件是实时发生的,但也丰富了他们实验中的碱基编辑细胞。在过去的几年里,科学家已经创造了一系列的基础编辑记者,可以帮助你做到这一点。

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主题:CRISPR,基本编辑

新一代腺嘌呤基编辑器改进了原代人类细胞的编辑

发布的苏珊娜Bachle2020年5月7日上午9:15:00

腺嘌呤碱基编辑器(ABE)介导A•T-to-G•C碱基变化(图1),但要做出这些碱基变化是有挑战性的,尤其是在原发人类细胞中。现在,科学家们束治疗已经发现了一种方法来改进对原始人类细胞的编辑(Gaudelli et al., 2020)。

广泛使用的一种基本编辑系统,ABE7.10(新一代ABEs的起点),由3个组件组成:

  • 脱氨酶一种脱氨酶(TadA,最初来源于大肠杆菌,命名为TadA7.10在ABE7.10)
  • 一种催化受损的Cas蛋白(dCas或Cas nickase)
  • 一种导向RNA,它能将TadA和dCas的复合物靶向到感兴趣的基因组DNA上
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主题:CRISPR,基本编辑

扩大腺嘌呤基编辑器的定位范围和编辑效率

发布的苏珊娜Bachle2020年3月17日上午9:32:55

David Liu的实验室创造了第一个基本编辑在2016年(Komor等人,2016年),并从那时起一直试图扩大他们的精确编辑能力。基本编辑使特定的DNA碱基变化,并且由融合到DNA修饰酶,在这种情况下,脱氨酶催化受损CAS大全MSDS蛋白(DCAS或CAS切口酶)的。从C•G-到-T•基变化是由胞嘧啶碱基编辑器(的CBE),并从A•T-到-G•C碱基的变化介导的由腺嘌呤碱基编辑器(ABES)介导的。这是如何运作的?通过分子生物学团队精神。该引导RNA(gRNA)指定DNA上的编辑目标部位,在CAS域指示修饰酶到目标部位,且脱氨酶诱导DNA碱基变化没有DNA双链断裂。但基础的编辑是不完美的。他们可能会很慢,只能针对特定网站,或只作碱基替换的一个子集。

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主题:CRISPR,基本编辑

主要编辑:增加精度和灵活性的CRISPR编辑

发布的曾珍2019年10月24日上午9:26:53

更新2020年6月5。

在人类身上发现了超过75,000种致病性基因变异,并被收录在ClinVar数据库。以前开发的基因组采用核酸酶的编辑方法和基本编辑只能纠正大多数细胞类型中少数的变异。一项新技术大卫刘的实验室在布罗德学院可以增加更多的精确度和灵活性CRISPR编辑世界。

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主题:CRISPR,中科院蛋白质,CRISPR gRNAs,基本编辑

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